霜霉病是广东黄瓜最常见的病害之一，主要危害叶片。发病初期叶片出现水渍状小斑点，后扩大为不规则黄褐色病斑，受叶脉限制呈多角形。湿度大时病斑背面产生紫黑色霉层。防治方法包括选用抗病品种、合理密植、控制湿度、及时清除病叶。发病初期可用72.2%霜脲锰锌可湿性粉剂800倍液或68%精甲霜灵锰锌可湿性粉剂600倍液喷雾防治，7-10天一次，连防2-3次。
白粉病主要危害叶片和茎蔓。发病初期叶片出现白色小粉斑，后扩大为圆形白粉斑，严重时叶片布满白粉，呈粉状。防治方法包括加强通风透光、控制氮肥用量、及时摘除病叶。发病初期可用25%苯醚甲环唑悬浮剂3000倍液或10%苯醚甲环唑水分散粒剂1500倍液喷雾防治，注意轮换用药，避免产生抗药性。
疫病主要危害茎基部、叶片和果实。茎基部发病呈水渍状暗绿色软腐，叶片发病呈水渍状大斑，果实发病呈暗绿色水渍状腐烂。防治方法包括高畦栽培、合理灌溉、及时排水。发病初期可用64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液或72%锰锌可湿性粉剂600倍液喷雾防治，重点喷洒茎基部和病部。
炭疽病主要危害叶片、茎和果实。叶片发病出现圆形或近圆形褐色病斑，边缘深褐色，中央灰白色，有同心轮纹。果实发病出现凹陷褐色病斑，有黑色小点。防治方法包括种子消毒、轮作倒茬、清洁田园。发病初期可用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液或70%甲基托布津可湿性粉剂1000倍液喷雾防治。
病毒病由蚜虫、粉虱传播，发病后叶片出现花叶、畸形、矮化等症状。防治方法包括拔除病株、防治传毒昆虫、选用抗病品种。发现病株及时拔除并销毁，同时用10%吡虫啉可湿性粉剂2000倍液或3%啶虫脒乳油3000倍液防治蚜虫、粉虱，切断传播途径。