条锈病是山西小麦的头号病害，春季流行时可在短期内造成严重减产。典型症状：叶片上出现鲜黄色、椭圆形、排列成条状的夏孢子堆，破裂后散出黄色粉末。防治关键：秋苗期和春季早发期（3月中下旬）进行普查，发现病叶后立即用药。推荐药剂：亩用15%三唑酮可湿性粉剂60-80克，或12.5%戊唑醇水乳剂30毫升，兑水30公斤喷雾。重病田间隔7-10天再喷一次。注意轮换用药，避免抗性产生。
白粉病在肥水充足、密度大的麦田极易发生。发病初期叶片正面出现白色粉状霉斑，逐渐扩大覆盖整叶，严重时穗部受害。防治适期：小麦拔节至孕穗期，当病叶率达5%时立即用药。选用药剂：亩用25%醚菌酯悬浮剂30毫升，或50%嘧菌酯水分散粒剂20克，兑水30公斤喷雾。多雨天气需在药液中加入有机硅助剂，提高附着性。连续用药不超过3次。
赤霉病是穗期重要病害，遇连续阴雨或大雾天气极易暴发，且会产生毒素影响粮食品质。典型症状：小穗颖壳上出现水渍状褐色病斑，后期产生粉红色霉层，籽粒干枯发白。防治策略：关键在于提前预防，在小麦齐穗至初花期（10%扬花时）喷药。推荐药剂：亩用25%氰烯菌酯悬浮剂100毫升，或40%戊唑·咪鲜胺水乳剂40毫升，兑水30公斤均匀喷施穗部。如果用药后6小时内下雨，需补喷一次。山西南部麦区要特别重视该病的防控。
纹枯病主要发生在茎基部，苗期至拔节期均可侵染。症状：叶鞘上出现水渍状云纹状病斑，严重时茎秆缝缩，植株枯死或倒伏。防治关键：返青期至拔节前，当病株率达10%时，亩用20%井冈霉素可溶粉剂30克，或24%噻呋酰胺悬浮剂20毫升，兑水30公斤顺垄喷淋茎基部。发病严重田块间隔10天再用药一次。注意避免氮肥过量，减轻病害发生。
全蚀病是土传病害，在山西部分地区呈加重趋势。症状：植株矮化，根系变黑腐烂，拔起时整株容易脱根，在茎基部可见“黑脚”。防治措施：重点在种子处理，用2.5%咯菌腈悬浮种衣剂10毫升拌种1公斤。轮作倒茬，与非禾本科作物轮作2年以上。发现病株及时拔除，并用石灰粉消毒病穴。发病田块亩用70%甲基托布津可湿性粉剂1公斤兑水200公斤灌根。